Thèse soutenue le 01 février 2022 pour obtenir le grade de docteur de la Communauté Université Grenoble Alpes - Spécialité : Chimie Biologie
Résumé : Dans le cadre de l’amélioration des procédés d’analyse de biologie médicale et particulièrement des méthodes de diagnostic, les vésicules extracellulaires apparaissent comme des biomarqueurs avec un fort potentiel depuis une dizaine d’années. En effet, elles portent la signature protéique de leurs cellules émettrices, ce qui peut être exploité comme outil de diagnostic. Cependant, la communauté scientifique fait face à un manque d’outil technologique pour l’isolement de ces biomarqueurs au vu de l’hétérogénéité de l’échantillon nanométrique. Ces limites freinent l’utilisation de ces nouveaux types de biomarqueurs en diagnostic clinique. Ainsi, de nouvelles méthodes sont requises pour effectuer un isolement efficace, simple et rapide des vésicules extracellulaires à partir d’une biopsie liquide. Le développement d’un système utilisant des nouvelles technologies à la frontière des domaines de la microfluidique et de la biochimie s’inscrit dans cette évolution. La technique microfluidique de tri en taille de Déplacement Latéral Déterministe (DLD) apparaît comme une des technologies prometteuses pour le tri passif d’objets biologiques. L’association tri en taille et biomarqueur-spécifique est alors permise par la combinaison d’un système DLD couplé à des aptamères ciblant les protéines biomarqueurs d’intérêt. Les possibilités de capture spécifique des vésicules extracellulaires par les aptamères ont été étudiées comme sondes alternatives aux anticorps via la mise en place d’une nouvelle méthode de détection. En parallèle, le développement d’un système microfluidique DLD pour l’isolement des vésicules extracellulaires à partir de milieux biologiques complexes comme alternative aux méthodes conventionnelles a été réalisé. L’intégration du tri DLD biomarqueur-spécifique à l’aide d’aptamères a été abordé de façon à proposer d’un système microfluidique complet d’analyse de vésicules extracellulaires à partir de liquide biologique.
Jury : Président : Monsieur Wilfrid Boireau
Rapporteure : Madame Myriam Taverna
Examinatrice : Madame Virginie Faure
Examinatrice : Madame Élodie Sollier
Invité : Monsieur Pascal Colosetti
Directeur de thèse : Yoann Roupioz
Co-encadrante de thèse : Aurélie Thuaire
Mots clés : Vésicules extracellulaires, Microfluidique, Aptamères, DLD, Biomarqueurs, Cancer
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